製品構成
Daylight C.I.S.社製ソフトウェアは、「データベースシステム」「データ処理ツール」「Webサービス」「ツールキット」の4つに大別されます。
このほか、OracleデータベースやPostgreSQLデータベースに化学情報の処理機能を追加する「DayCart」も用意されています。
データベースシステム

データベースシステムには、THOR/Merlinサーバシステムと、それを利用するためのツールが用意されています。
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THOR system | 化学情報データベースの登録と参照 |
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Merlin system | 高速検索と探索的データ解析 |
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Database Management Package | データベースシステムの管理ツール(オプション) |
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Merlin Control Language | Merlin検索自動化用のスクリプト言語(オプション) |
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Reaction Package | 反応データベース機能(オプション) |
また、THOR/Merlinデータベースで利用可能なデータコンテンツも取り扱っています。
データ処理ツール

データ処理ツールは、データベースシステムやツールキットの機能を補完し、より高度な機能を提供します。
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Clustering Package | 大規模セットのクラスター解析 |
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Printing Package | テキストとグラフィックスのPostScript出力 |
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Convert Package | 構造データ形式の相互変換 |
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sdcluster | 母核によるクラスタリング |
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tautomer | 互変異性体構造の生成 |
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DayProp | 各種分子記述子の計算 |
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ClogP | ClogPおよびCMRの推算 |
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DayCGI | Daylightソフトウェアの機能を利用するためのwebツール |
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Rubicon | ルールベースの配座発生 |
Webサービス

Webサービスは、WebアプリケーションからDaylightソフトウェアの機能を利用するための、Javaで作成されたコンポーネント集です。
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canonicalizeSmiles | SMILESの正規化(canonical SMILESへの変換) |
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normalizeSmiles | 与えられた規則に従ったSMILESの標準化 |
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getTransform | 与えられた化学反応(SMIRKS)に従ったSMILESの変換 |
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convertStructure | MOL/SD/RD形式、SMILES形式、THOR形式の相互変換 |
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desaltSmiles | SMILESの脱塩処 |
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getTautomers | 互変異性体構造の生成 (tautomerツール参照) |
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getProperties、getClogP | 分子記述子・物性推算値の計算 (DayPropツール参照) |
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getClogP | ClogPおよびCMR (ClogPツール参照) |
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getDepiction | 分子構造の描画 |
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deriveScaffold | 共通部分構造の抽出 |
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deriveSDClusters | 共通部分構造によるクラスタリング (sdclusterツール参照) |
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generateRTable | deriveSDClustersで得られたクラスタから置換基リストを作成 |
ツールキット

ツールキットは、Daylightシステムへのインタフェースを提供する、C/C++/FORTRAN用プログラミングライブラリ群です。
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SMILESツールキット | 分子オブジェクトとSMILES言語の取り扱い |
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SMARTSツールキット | 部分構造認識とSMARTSパターン言語の取り扱い |
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Fingerprintツールキット | フィンガープリントの生成とカスタマイズ |
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THORツールキット | THORシステムの利用 |
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Merlinツールキット | Merlinシステムの利用 |
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Reactionツールキット | 化学反応の取り扱い |
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Depictツールキット | 2Dと3Dの描画情報の生成 |
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HTTPツールキット | インターネットを経由した化学情報伝達 |
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Program Objectツールキット | 外部プログラムをDaylightオブジェクトとして利用 |
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X-Widgetsツールキット | X-View グラフィカルインタフェースの部品 |
カスタマイズ可能なサードパーティー製品や、ユーザーの独自開発プログラムなどにツールキットを組み込むことで、それらのソフトウェアからDaylightソフトウェアの機能を利用できるようになります。
DayCart

DayCartは、OracleおよびPostgreSQLデータベースに構造情報の格納・検索機能を追加するカートリッジです。