メタゲノム解析のデータセットは異なる微生物のゲノムに由来する数百万のショットガンシークエンスによるリードから構成されます。このような大規模で断片化したデータをより分けてそれぞれのリードがどの微生物に由来するかを調べることは複雑なだけでなく計算機の能力も要求されます。Partek Flowでは超高速のメタゲノム配列分類ツールであるKrakenを利用できます。Krakenは数千の微生物の参照配列を含む公共データベースを利用して、それぞれのリードの系統解析を高速に実行します。

メタゲノム解析における基本的な興味の1つは、実験群間で微生物の多様性がどれくらい異なるかという点です。1つの方法はサンプル内のα多様性を測定して、α多様性を使って多様性の変化を表示することです。しかし、この方法は統計的な厳密さを欠き、異なる実験デザインを説明できません。Partekは、微生物の多様性のパターンをよりよく理解するために微生物の多様性における意味のある変化を検出する強力で自由度の高いANOVA統計機能を提供します。

すべての研究者は異なる研究課題を持っています。ある研究者は臨床検体中に存在するレスピロウイルスのどんな種類があるかを研究しようとしているかもしれませんし、別の研究者は異なる食餌で細菌叢がどのように変化するかを研究しようとしているかもしれません。したがって、研究課題に即したデータ解析のニーズがあります。Partek Flowに搭載された自由度の高いライブラリーファイル管理ツールにより、メタゲノム解析の配列検索を実行するのに必要なカスタムデータベースを作ることができます。これにより検索を微調整したり、可能な限り広くしたりできます。