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ノンコーディングRNAの発現

ノンコーディングRNA(ncRNA)の機能的な重要性の理解は深まっています。マイクロRNA(miRNA)、長鎖型ノンコーディングRNA(lncRNA)、piwi-interacting RNA(piRNA)などを含む複数の種類が存在します。NGSあるいはマイクロアレイのどちらかのデータがあれば、Partekが提供する使い勝手の良いソフトウェアにより一連の解析を行うことができます。
workflow
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最新のデータベースに対応した柔軟なライブラリー管理

データベース

ncRNAの理解は深まっているので、利用可能な公共データベースが作成されます。最新の知識に遅れずについていくことは困難を伴い、異なる書式で情報が保存された別々のデータベースによりさらに複雑になります。Partekのソフトウェアは柔軟なライブラリーファイル管理システムによりそのプロセスを容易にします。最新のアノテーションデータベースを自動的にダウンロードしたり、あらゆる情報源から得られるあらゆる書式(GTF、GFF3、BEDなど)のカスタムncRNAを追加したりできます。

公共データベースの解析とRNAデータとの統合

統合解析

Partekは、ncRNAのリストに対する潜在的な標的遺伝子を発見するために公共データベースの解析を行う使い勝手の良い解析ソフトウェアを提供しています。さらに、ncRNAと遺伝子の発現データを統合して新しい機能的な発見をもたらします。ncRNAはトランスクリプトームにわたって遺伝子発現を調節するために機能します。PartekのソフトウェアはncRNAと遺伝子の発現の間の相関を理解するのに役立ちます。

バイオマーカー検出のための強力で信頼性の高い統計解析

統計解析

ncRNAの遍在性と生命における基本的な重要性から、疾患のバイオマーカーとしてこれらの分子を使用する注目度が増しています。重要な第一歩は異なるサンプルのグループにおいて発現が変動しているncRNAを見つけることです。これはもっともよい候補となる分子を正確に特定するためにPartekのソフトウェアが搭載しているような強力で信頼性の高い統計解析機能を必要とします。Partekのソフトウェアは、統計解析に慣れている研究者も慣れていない研究者も同様に使いやすい独自の統計アルゴリズムと公知の統計アルゴリズムを組み合わせて使用しています。