独Konstanz大学で開発されたワークフロー作成ツールです。
KNIME^®のホームページ （http://www.knime.org ）

特長：

– 誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 – 直感的で操作しやすいGUI – 処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 – 多くの創薬研究のためのノードを用意・・・ケムインフォマティクス、データマイニングなど – サードパーティ製品を組み込んだ新規ノード開発も可能

BioSolveIT KNIME ExtensionsはワークフロープラットホームKNIME^®上で創薬支援ツールを利用するための解析ノードの総称です。創薬支援ツールを実行するためのノードが提供され、化合物処理だけでなくSBDD・FBLDのためのワークフローも構築可能です。

BioSolveIT社ではおもに次のようなKNIME^®ノード群を提供しています。

– Docking in KNIME^® – FTrees in KNIME^® – Fragment Spaces in KNIME^® （FTrees-FS） – FlexS in KNIME^® – Assess Affinity with Hyde – Run ReCore Interactively

例：FTreesによる類似構造検索を行うKNIME^®ワークフロー

このワークフローは分子データの入力、化合物を化学的な特性がつながった木構造（Feature Trees）に変換、類似度計算、クエリーと比較対象分子群のFeature Treeマップの出力まで処理を行うワークフローです。