​​MOE-カスタマイズと開発環境

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title:{概要} 

MOEは、さまざまなプラットフォームで利用でき、ユーザーの用途に合わせたカスタマイズが可能なソフトウェアです。

研究者間での連携、様々な利用方法

  • MOE : マルチOS（Windows, Mac, Linux）
  • MOE/web : HTTP, SOAP, JAVA
  • MOE/smp : パラレル計算
  • 社内のデータベースとの統合

カスタマイズ / スペシャライズ

  • 既存機能のカスタム
  • 新しいアプリケーションの開発
  • メニューやボタンバーのカスタム
  • サードパーティソフトウェアとの連携

オープンアーキテクチャー

  • MOEのアプリケーションはSVLで記述
  • “ブラックボックスではない”: アプリケーションのソースコードを提供
  • “モジュール単位ではない”:　MOEはオールインワンパッケージ
  • ウェブサイト「SVL Exchange」では多くのカスタムSVLをダウンロードできます。

title:{SVLによる高い拡張性}

​​MOE のオープン アーキテクチャと、組み込みの高水準プログラミング言語 SVL ( Scientific Vector Language)を組み合わせることで、高い柔軟性が実現します。 MOE と SVL を使用すると、新しいアイデアや方法を短時間で検討・実装することができます。 SVL で記述されたアプリケーションは、MOE が実行されるすべてのプラットフォームで利用できます。

SVLには次のような特徴があります。
1) 開発用としての言語:
シンプルな記述で、デバッグ、プログラムの理解が容易で、幅広いアプリケーションでを作成することができます。

2) 対話型および非対話型実行:
SVL はコマンド ライン インターフェイス(CLI)で対話型で実行できますが、非対話型で呼び出すこともできます。

3) ユーザーによる拡張可能:
ユーザーは、既存のアプリケーションのカスタマイズに加え、独自のアプリケーションを開発することが可能です。


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title:{サードパーティーソフトウェアとの連携}

１．MOEからサードパーティーソフトウェアを利用する
Amber、Gaussian、MOPAC、CORINAなどをMOEから呼び出して利用することができます。

  • MOEからサードパーティーソフトウェアにデータを入力
  • サードパーティーソフトウェアで計算
  • サードパーティーソフトウェアからMOEにデータを出力

インターフェース1

2．サードパーティーソフトウェアからMOEを利用する
MOEの解析機能をKNIME, Pythonなどから呼び出して利用することができます。

  • サードパーティーソフトウェアからMOE/batchにデータを入力
    • MOE/batchで計算
  • MOE/batchからサードパーティーソフトウェアにデータを出力

インターフェース2

title:{MOEの実行モード} 

ユーザーや目的によって実行モードを選択可能

  • MOE/GUI
  • MOE/batch
    　- Windowsのターミナル、Linux・Macのターミナルから利用
    　- リモート操作が容易
        - ライセンストークンの節約
  • MOE/cluster
    　- クラウドコンピューティング
    　- SLURM、UNIVA、SGE、LSFを使ったジョブ管理
  • MOE/web
        MOE/webアプリケーション ブラウザー経由でMOEの計算を実行
        - MOEsaic (SAR、MMP)
        - Combinatorial Library
        - 抗体モデリング
        - スケッチャー
        - 分子構造表示
        - カスタムアプリケーションの作成も可能 
  • MOE/SOAP

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